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          Easy Target?

          Easy Target?高通量目標基因片段快速富集技術:

                EasyTarget?技術為上海天昊生物又一全新的專利技術,針對目的區域設計的EasyTarget引物及探針,通過延伸連接反應富集目的片段,對研究者感興趣的基因組區域進行捕獲富集。一個延伸連接反應體系可以獲得<200Kb的區域內所有目的片段的連接產物,該技術方法實驗快速、步驟簡單,直接富集擴增效率極高,無需復雜的建庫過程,此外利用Illumina Miseq測序儀的2X250bp測序模式對目的片段實現雙向測序驗證,大大提高二代測序的數據準確度。該方法非常適合數百個樣品<200Kb的多個候選基因外顯子富集二代測序項目。

          服務流程:

                1)課題的設計咨詢包括候選基因區域的評估與確定、富集及二代測序方法選擇;

                2)設計覆蓋目的區域的Easy Target?引物和探針、合成并優化反應體系;

                3)DNA樣本的之間與標化;

                4)Easy Target?延伸連接、擴增反應、樣品標記等;

                5)Illumina Miseq2×250bp測序;

                6)生物信息學分析與篩選;

                7)目的區域內選取12-16個高頻SNP位點進行分型驗證,對二代測序基本結果評估。


          專業的生物信息分析:

                1. 根據變異位點附近序列特征進行注釋,提示可能因高同源性區域或鄰近簡單重復序列存在等序列原因帶來的測序假陽性結果。

                2. SNV CallingGenotype Calling獨立分析,提高分型準確性:首先利用高質量樣本分型建立所有SNV的位點庫,利用位點庫信息調取每個樣品原始測序結  果,判斷樣品的分型結果。利用雙向測序平衡性卡方檢驗、二項分布概率評估以及貝葉斯法概率估計對樣品進行候選SNV位點的基因型判讀,并給出準確性水平,并進一步利用Hardy-Wenberg equilibrium檢驗對SNV位點進行可靠性評估。
                3. 對于病例-對照樣本,可提供高頻SNP位點的關聯分析以及以基因為單元的稀有突變分布差異分析。


          我們的特色:
                1.實驗技術方法靈活:多種策略可供選擇,適合各種規模的目標區域二代測序項目。

                2.極具特色的實驗質控體系:利用SNaPshot多重SNP分型技術對目標區域內的12個高頻SNP位點進行SNP分型質控,判斷測序數據和樣品標記的準確性。

                3.經驗豐富的生物信息學和遺傳學分析團隊:結合多年豐富的遺傳分析經驗,開發了一套理論基礎扎實、實用性強的二代測序數據分析體系,為研究者更好的判斷和分析二代測序的結果提供了指導性的幫助。

                4.天昊將協助客戶進行實驗設計,完備的實驗設計是項目成功的關鍵!


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